[TMAP]TMAP설치

< 선행설치>

1. autoconf 설치 (2.65 이상의 버전)

다운로드 - http://ftp.gnu.org/gnu/autoconf/

설치 - ./configure, make, make install

(필요할경우) vi /etc/profile 에서 export PATH=/usr/local/bin:$PATH 추가

2. automake 설치

다운로드 - http://ftp.gnu.org/gnu/automake/

설치 - ./configure, make, make install

3. m4 설치

다운로드 - http://ftp.gnu.org/gnu/m4/

설치 - ./configure, make, make install

4. SSE2 지원 확인

cat /proc/cpuinfo 시에 flags 부분에 sse2 가 있는지 확인

5. git 설치 및 TMAP 다운로드

$> yum install git-XXX

$> git clone git://github.com/iontorrent/TMAP.git  (방화벽 9418 오픈되어 있어야함)

$> cd TMAP

$> git submodule init

$> git submodule update

<TMAP 설치>

1. 설치

$> cd TMAP

$> chmod +x autogen.sh

$> chown -R user.group ../TMAP

$root> sudo ./autogen.sh (perl모듈 사용으로 root로 해야하는 경우 있음)

$> mkdir ~/install/TMAP_130122

$>./configure --prefix=~/install/TMAP_130122

$root> sudo make (perl모듈 사용으로 root로 해야하는 경우 있음)

$> make install